Les colonies redeviennent objet de débat sous la Révolution, à propos de l'esclavage qui est aboli par la Convention mais rétabli par Bonaparte . Ce dernier vend la Louisiane, à peine récupérée sur l’Espagne en 1800, aux États-Unis en 1803. En 1804, le dernier fleuron de l’empire colonial, Saint-Domingue proclame son indépendance et devient la République d'Haïti.
Après la chute du Premier Empire, la France cède Tobago, Sainte-Lucie, les Seychelles et l'île de France à la Grande-Bretagne. En 1815, elle ne conserve plus qu’un ensemble à la superficie modeste.

Sous la Révolution française, une dizaine de régiments de la Marine passent à la Guerre et deviennent des régiments d’infanterie. Le régiment royal d’artillerie des colonies, quant à lui, devient le 8e régiment d’artillerie.
L’artillerie de marine participe aux campagnes de la Révolution et de l’Empire avec sept demi-brigades, et, à partir de 1804, avec quatre régiments d’artillerie de marine. Ceux-ci s’illustrent en 1813 et 1814, notamment aux batailles de Lutzen et Hanau.